The Wave Organ ligger i änden av molerna som omsluter den lilla båthavnen i Marina. Det är en ljudskulptur byggd 1986 av Exploratorium, gjord av uthuggad granit och marmor som räddades från en rivd kyrkogård. Tjugofem rör sträcker sig ner i bukten på olika nivåer.
När vågorna rör sig in och ut trycks vatten genom rören och producerar låga gurgel-, väsande och snurrande ljud. Ljudet är subtilt och fungerar bäst vid högvatten. Promenaden ut på molerna ger en tydlig utsikt över staden, bron och Palace of Fine Arts-kupolen.
