Ang Wave Organ ay nasa dulo ng jetty na nagsasara sa Marina small craft harbor. Ito ay isang sound sculpture na itinayo noong 1986 ng Exploratorium, ginawa mula sa carved granite at marble na nagsagawa mula sa isang demolition cemetery. Dalawampung limang pipes ay umaabot papunta sa bay sa iba’t ibang levels.
Habang ang mga alon ay gumagalaw papasok at papalabas, ang tubig ay nagtutulak ng hangin sa pamamagitan ng mga pipes at lumilikha ng mababang gurgles, hisses, at hums. Ang tunog ay subtle at gumagana nang higit na mahusay sa high tide. Ang hakbang sa jetty ay nagbibigay ng malinaw na view papunta sa lungsod, ang tulay, at ang Palace of Fine Arts dome.