Das Fairmont war fast fertig, als das Erdbeben und der Brand von 1906 zuschlugen. Die Granitschale blieb erhalten, das Innere brannte aus, und das Hotel öffnete genau ein Jahr später im April 1907, wieder aufgebaut unter Architektin Julia Morgan. Es wurde zum gesellschaftlichen Zentrum der wieder aufgebauten Stadt.
Die UN-Charta wurde 1945 teilweise im Fairmont verhandelt. Die Lobby ist zum Durchgehen offen mit ihren Marmorsäulen und Golddetails. Die Tiki-Bar im Keller, die Tonga Room, hat einen funktionierenden künstlichen Regen über einer Lagune und läuft seit 1945.