The Fairmont estaba casi terminado cuando el terremoto e incendio de 1906 golpeó la ciudad. La estructura de granito sobrevivió, el interior se quemó, y el hotel abrió exactamente un año después, en abril de 1907, reconstruido bajo la arquitectura de Julia Morgan. Se convirtió en un centro social de la ciudad reconstruida.
La carta de las Naciones Unidas fue negociada en parte en The Fairmont en 1945. El vestíbulo está abierto al público, con sus columnas de mármol y detalles dorados. El bar tiki en el sótano, el Tonga Room, tiene una lluvia interior artificial sobre una laguna y ha funcionado desde 1945.
